Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms