Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW66

CINP, Cyclin-dependent kinase 2-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CINPQ9BW66 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CINPQ9BW66 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CINPQ9BW66 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms