Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC4

MLST8, Target of rapamycin complex subunit LST8, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLST8Q9BVC4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLST8Q9BVC4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLST8Q9BVC4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms