Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB2BQ9BVA1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB2BQ9BVA1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms