Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAGR1Q9BTK6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms