Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT11Q9BT88 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms