Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms