Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MXRA8Q9BRK3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MXRA8Q9BRK3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
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