Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms