Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms