Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms