Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms