Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R9BQ96SB3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R9BQ96SB3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R9BQ96SB3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R9BQ96SB3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R9BQ96SB3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R9BQ96SB3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R9BQ96SB3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R9BQ96SB3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R9BQ96SB3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R9BQ96SB3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R9BQ96SB3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R9BQ96SB3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R9BQ96SB3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R9BQ96SB3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R9BQ96SB3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R9BQ96SB3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP1R9BQ96SB3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP1R9BQ96SB3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP1R9BQ96SB3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP1R9BQ96SB3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP1R9BQ96SB3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP1R9BQ96SB3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP1R9BQ96SB3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms