Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBGCP5Q96RT8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms