Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF12Q96QT6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms