Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms