Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TEFMQ96QE5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms