Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms