Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM20AQ96MK3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms