Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms