Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLMNQ96JQ2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLMNQ96JQ2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLMNQ96JQ2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLMNQ96JQ2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLMNQ96JQ2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLMNQ96JQ2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLMNQ96JQ2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLMNQ96JQ2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms