Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms