Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms