Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms