Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms