Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM12Q96EX1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms