Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC5Q96DU9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms