Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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RNF183Q96D59 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF183Q96D59 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF183Q96D59 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF183Q96D59 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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RNF183Q96D59 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF183Q96D59 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF183Q96D59 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF183Q96D59 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF183Q96D59 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF183Q96D59 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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RNF183Q96D59 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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RNF183Q96D59 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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RNF183Q96D59 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF183Q96D59 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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RNF183Q96D59 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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RNF183Q96D59 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RNF183Q96D59 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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