Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NMD3Q96D46 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms