Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms