Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms