Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms