Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HLA-CQ95604 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms