Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A3Q93084 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2A3Q93084 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms