Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP9XQ93008 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP9XQ93008 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP9XQ93008 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP9XQ93008 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP9XQ93008 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP9XQ93008 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP9XQ93008 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP9XQ93008 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP9XQ93008 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP9XQ93008 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP9XQ93008 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP9XQ93008 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
USP9XQ93008 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP9XQ93008 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
USP9XQ93008 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP9XQ93008 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP9XQ93008 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms