Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms