Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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