Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
U2AF1L4Q8WU68 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms