Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms