Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELBQ8NG08 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms