Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL22A1Q8NFW1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms