Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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