Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms