Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATAD1Q8NBU5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATAD1Q8NBU5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD1Q8NBU5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD1Q8NBU5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD1Q8NBU5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD1Q8NBU5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD1Q8NBU5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD1Q8NBU5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD1Q8NBU5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD1Q8NBU5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD1Q8NBU5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD1Q8NBU5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD1Q8NBU5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD1Q8NBU5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD1Q8NBU5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD1Q8NBU5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD1Q8NBU5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD1Q8NBU5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD1Q8NBU5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms