Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms