Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms