Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM71DQ8N9W8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM71DQ8N9W8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms