Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP3Q8IZU3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms