Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms