Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBBP6Q7Z6E9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms